Soy-yamghurt merupakan produk fermentasi sari kedelai dan ubi banggai yang dibuat dengan menambahkan bakteri asam laktat yang relatif lebih awet dibandingkan susu segar atau susu bubuk. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kadar total metabolit sekunder dan mengetahui perbandingan terbaik dari nilai IC50 formula soy-yamghurt. Metode yang digunakan eksperimen laboratorium, formula dibagi menjadi 3 konsentrasi yaitu F1 1:1, F2 1:2 dan F3 2:1. Spektrofotometer Uv-Vis digunakan untuk penetapan kadar total metabolit sekunder dan uji antioksidan menggunakan metode DPPH. Hasil yang didapat kadar total metabolit sekunder senyawa Alkaloid F1 0,10% v/v, F2 0,01% v/v, dan F3 0,01% v/v, senyawa Flavonoid F1 014% v/v, F2 0,12% v/v, F3 0,13% v/v, senyawa Tanin F1 0,27% v/v, F2 0,26% v/v, F3 0,14% v/v dan senyawa saponin F1 1,15% v/v, F2 1,22% v/v, F3 1,25% v/v. Hasil IC50 terbaik dari formula Soy-yamghurt terdapat pada F2 : 27,75 ppm (sangat kuat), F1 : 179,93 ppm (lemah) dan F3 : 755,53 (tidak aktif).